随着我国社会主义市场经济的发展，社会主义新农村建设与和谐社会的构建，科技体制改革逐步深化，农业科研单位所面临的形势更加严峻、任务更加繁重，特别是农业部直属的中国农业科学院、中国水产科学研究院和中国热带农业科学院（以下简称直属科研单位），承担着我国农业发展的全局性、方向性、基础性、关键性的重大科技任务，同时还要适应市场经济发展的需要和国家科技体制改革的要求，转化科技成果，长入市场经济，为经济建设服务。直属科研单位的内外环境逐步转变。在财政方面，国家加快了改革步伐，建立了公共财政框架、实行部门预算、实施国库集中支付制度和政府采购制度等。在直属科研单位的内部，资金状况发生了很大变化，一方面是国家对项目经费的投入有较大幅度增长；另一方面是科研单位经营收入的较快增长，资金运行总量显著加大。而同期，国家的经常性科学事业费投入增长缓慢，经常性事业费支出却又增长较快，资金收、支结构性失衡的矛盾比较突出。在这种新形势下，出现了许多新情况新问题，加强财务管理显得更加重要。基于以上情况，农业部科技教育司委托中国农业科学院甜菜研究所主持开展了直属科研单位财务管理和监督机制的研究，成立了“新形势下农业部直属科研单位财务管理和监督机制研究”课题组，组织了直属科研单位财务管理方面的业务骨干，开展研究工作。经过两年的国内外调查研究，形成了“研究报告”，较全面地分析了直属科研单位财务管理的背景、现状、总结了管理经验，提出了存在的问题和对策、建议。课题组在进行研究的同时，还广泛发动直属科研单位财务人员，结合工作实践撰写论文，共征集财务管理、预算管理、项目经费管理、国库管理、国有资产管理、财务监督与控制等方面的论文50余篇。