用人单位可以根据本单位经济效益，自主决定工资分配方式以及工资结构包括年终奖是否发放、发放金额、标准等。
但用人单位应该要做到以下几点：
1.在劳动合同或规章制度中对年终奖的性质进行明确规定，明确年终奖是属于劳动报酬还是奖励金。2.对发放时间、发放对象、发放标准、发放条件，包括对不予发放的情形进行明确约定。3.对于不符合发放条件的劳动者，也要有相关证据，若是通过绩效考核的方式发放年终奖，应有明确的绩效考核标准和考核证据。4.同时，要确保规章制度程序的合法性，通过规章制度对年终奖进行规定的，应当告知并公示给劳动者，并让劳动者签字确认。
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